1. Web版3D可視化網站:本網站支持斑馬魚、小鼠、猴等多物種多類型數據的在線展示,包含神經元、腦區、品系、細胞構筑等數據。此外,網站還支持數據檢索、數據顏色、透明度、可見性等屬性設置。
2. BrAVe (BrainAltas Viewer)腦圖譜數據3D可視化軟件: 本軟件基于開源軟件Paraview,支持腦圖譜數據三維交互可視化,目前支持的數據類型包括:神經元、腦區、細胞構筑、品系數據,也支持神經元形態分析、神經元-腦區投射分析和腦區-腦區投射分析以及分析結果可視化。
本軟件需要特別致謝斑馬魚腦圖譜團隊(杜久林研究組和斑馬魚介觀腦圖譜平臺),該團隊組織了本軟件早期版本的開發,并且設計了許多有用的功能,功能列表可向斑馬魚腦圖譜團隊或者數據與計算中心查詢。
本軟件當前只面向腦智中心的用戶公開,但是如果需要使用本軟件的功能發布論文或者進行相關技術匯報、交流,需要聯系數據與計算中心,并征得相關人員的同意。
3. 數據分析和機器學習:海量腦數據的處理已成為神經科學研究和實踐中的常態,這對于揭示隱藏的信息以更好地了解大腦功能和信息處理機制至關重要。關于機器學習,我們的目標是研究如何有效地將這些機器學習算法應用于典型的神經問題。
4. 生物信息學分析:生物信息學分析涉及到全基因組測序實驗設計、全基因組測序數據分析、外顯子組測序實驗設計和外顯子組測序數據分析等。